Mitsuha Miyamizu, una chica que vive en un pequeño pueblo en las montañas, está harta de su vida aburrida y desea poder vivir en Tokio, la ciudad moderna. A menudo, expresa su deseo de ser una chica de ciudad, y a veces sueño con ser un chico en lugar de una chica. Por otro lado Taki Tachibana es un joven de Tokio que lleva una vida relativamente normal, pero está lidiando con la falta de orientación en su vida y con sus sentimientos por una chica de su clase. Un día, sin razón aparente, ambos jóvenes comienzan a experimentar un fenómeno muy extraño: se intercambian los cuerpos sin previo aviso.