Esta segunda entrega arranca en 1940, justo donde terminó la primera novela (Miss Peregrines Home for Peculiar Children). Tras huir por muy poco de la isla de Miss Peregrine, Jacob y sus nuevos compañeros deben emprender un viaje hacia Londres, considerada la capital del mundo peculiar. En su camino se toparán con nuevos aliados, un curioso conjunto de animales extraordinarios y más de una sorpresa inesperada.